SYSTEMATISCHE SAMMLUNG
Die systematische Sammlung der Wirbellosen mit mehreren hunderttausend Exemplaren ist ein eigentliches Lexikon des Lebens. Aufgebaut ist sie nach der paläontologischen Systematik Stamm, Klasse, Ordnung, Familie, Gattung und Art.
Die Wirbellosen werden in dieser Sammlung nach dem Standardwerk der paläontologischen Bestimmung 'Treatise on Invertebrate Paleontology' geordnet und aufbewahrt. Obwohl die meisten Stämme, Klassen, Ordnungen und Familien durch Exemplare belegt sind, liegen die Schwerpunkte bei den jurassischen Korallen, Muscheln, Schnecken, Kopffüssern und den Seeigeln aus der Nordwestschweiz.
Besonders erwähnenswert ist die von Hans Hess aufgebaute Sammlung jurassischer Seelilien des Naturhistorischen Museums Basel. Für diesen Bereich gilt diese Sammlung weltweit als eine der komplettesten.
Kleine, interessante Spezialsammlungen wie etwa Missbildungen im Schalenbau von Ammoniten, Originalstücke aus der Ediacara-Fauna oder gefälschte Fossilien und Pseudofossilien sind jeweils den Hauptsammlungsgebieten angefügt.